İlaç tedavisi olarak etkili olabilecek lokal ilaçlar mevcuttur. Kondilomlar genellikle tekrarlayabilirler ve her tekrarda tedavi edilmesi gerekmektedir. Kondilom tedavisinde en çok uygulanan yöntem ise kondilomların yakılmasıdır. Kondilom yakma işleminde ise koter, leep cihazı veya lazer uygulanır. Ayrıca krioterapi de etkilidir. Krioterapi siğillerin dondurulması işlemidir. Çok büyük kondilomlarda cerrahi olarak çıkartılma (eksizyon) gerekebilir. Aynı anda koterizasyon da yapılır. Kondilom dondurma hariç diğer işlemler için lokal ya da tercihen genel anestezi uygulanır.